Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms