Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PDE6DO43924 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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