Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA8SH3BPF8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms