Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX13Q9Y5W8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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