Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms