Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNTN3Q9P232 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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