Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC22A11Q9NSA0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms