Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F12Q9HCS2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms