Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PUS3Q9BZE2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PUS3Q9BZE2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PUS3Q9BZE2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PUS3Q9BZE2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PUS3Q9BZE2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PUS3Q9BZE2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PUS3Q9BZE2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PUS3Q9BZE2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PUS3Q9BZE2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUS3Q9BZE2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms