Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GSDMCQ9BYG8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms