Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDC1Q96MU7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms