Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCZQ96LD1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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