Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms