Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDPD3Q7L5L3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms