Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms