Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms