Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
USF2Q15853 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
USF2Q15853 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USF2Q15853 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms