Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAPTM4AQ15012 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms