Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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SCARF1Q14162 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SCARF1Q14162 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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