Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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