Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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PKP1Q13835 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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PKP1Q13835 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP1Q13835 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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