Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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