Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 UBE2J2-211ENST00000466752 886 ntTSL 319.08■□□□□ 0.642e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-217ENST00000491779 611 ntTSL 219.08■□□□□ 0.642e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-220ENST00000509720 472 ntTSL 318.81■□□□□ 0.62e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-216ENST00000488418 750 ntTSL 218.67■□□□□ 0.582e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.552e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.352e-8■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-8■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-218ENST00000502382 530 ntTSL 416.21■□□□□ 0.192e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-215ENST00000477894 767 ntTSL 515.86■□□□□ 0.132e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.432e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 TRIM33-203ENST00000448034 2706 ntTSL 55.62□□□□□ -1.512e-8■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 XPO1-219ENST00000481073 3706 ntTSL 23.31□□□□□ -1.882e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 FOXL2NB-201ENST00000383165 3538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 MLLT6-208ENST00000619356 3868 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.111e-15■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 MLLT6-204ENST00000615441 395 ntTSL 313.43□□□□□ -0.261e-15■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 MLLT6-205ENST00000615741 2937 nt12.74□□□□□ -0.371e-15■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 NQO2-207ENST00000397717 833 ntTSL 516.74■□□□□ 0.276e-9■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.246e-9■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-13■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.136e-9■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.156e-9■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.36e-9■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.496e-9■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 NQO2-206ENST00000380472 689 ntTSL 511.57□□□□□ -0.566e-9■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 RPS27A-203ENST00000404735 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-13■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 RPS27A-202ENST00000402285 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.822e-13■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 NQO2-208ENST00000426637 626 ntTSL 58.09□□□□□ -1.116e-9■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 RPS27A-210ENST00000495843 1159 ntTSL 57.9□□□□□ -1.142e-13■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.246e-9■□□□□ 9.3
TARDBPQ13148 AL121845.3-202ENST00000632538 872 ntAPPRIS P1 TSL 320.37■□□□□ 0.851e-8■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 ZGPAT-211ENST00000484569 749 ntTSL 218.19■□□□□ 0.51e-8■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 GCN1-207ENST00000550471 918 ntTSL 320.1■□□□□ 0.811e-6■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 BAG6-243ENST00000434444 766 ntTSL 317.3■□□□□ 0.361e-7■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 BAG6-251ENST00000452994 880 ntTSL 314.95□□□□□ -0.021e-7■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 BAG6-254ENST00000456286 807 ntTSL 1 (best)13.07□□□□□ -0.321e-7■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 BAG6-253ENST00000454165 544 ntTSL 312.32□□□□□ -0.441e-7■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 BAG6-242ENST00000433828 902 ntTSL 211.86□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 BAG6-241ENST00000428326 1051 ntTSL 510.93□□□□□ -0.661e-7■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.943e-8■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 CEP192-215ENST00000589993 3284 ntTSL 56.73□□□□□ -1.333e-8■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.611e-8■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.41e-8■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.241e-8■□□□□ 9.2
TARDBPQ13148 MYO18A-220ENST00000588791 650 ntTSL 515.2■□□□□ 0.023e-8■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.023e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PHC2-210ENST00000485928 2548 ntTSL 221.27■■□□□ 13e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.043e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.146e-10■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.246e-10■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.263e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.343e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.353e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.473e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.523e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PHC2-204ENST00000431992 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 ATP6V0A1-205ENST00000544137 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.963e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.013e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 ZC3H15-201ENST00000337859 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.053e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 ZC3H15-209ENST00000498757 881 ntTSL 28.22□□□□□ -1.093e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SCAF4-204ENST00000467731 2976 ntTSL 1 (best)6.49□□□□□ -1.373e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 ZC3H15-204ENST00000445547 776 ntTSL 25.87□□□□□ -1.473e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SSBP2-210ENST00000508912 256 ntTSL 25.87□□□□□ -1.473e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 EML4-204ENST00000406175 4622 ntTSL 1 (best)5.74□□□□□ -1.493e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 ABCF1-207ENST00000542772 223 ntTSL 35.61□□□□□ -1.513e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SSBP2-206ENST00000506960 685 ntTSL 24.64□□□□□ -1.673e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.943e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 ATP6V0A1-210ENST00000586315 357 ntTSL 32.89□□□□□ -1.953e-6■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.124e-10■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SRSF3-203ENST00000477442 1095 ntTSL 513.39□□□□□ -0.274e-10■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SRSF3-201ENST00000339436 1518 ntTSL 212.52□□□□□ -0.44e-10■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SRSF3-204ENST00000613941 595 ntTSL 411.26□□□□□ -0.614e-10■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 MBNL1-208ENST00000460166 552 ntTSL 48.97□□□□□ -0.971e-8■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 MBNL1-216ENST00000478535 1451 ntTSL 1 (best)7.21□□□□□ -1.261e-8■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.414e-10■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 324.78■■□□□ 1.566e-13■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.146e-13■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 216.97■□□□□ 0.316e-13■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 315.9■□□□□ 0.146e-13■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.356e-13■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 510.61□□□□□ -0.716e-13■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.726e-13■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.86e-13■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.816e-13■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.836e-13■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 HNRNPH1-231ENST00000519033 832 ntTSL 316.7■□□□□ 0.265e-20■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 HNRNPH1-240ENST00000521720 539 ntTSL 316.41■□□□□ 0.225e-20■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 HNRNPH1-248ENST00000524179 598 ntTSL 214.6□□□□□ -0.075e-20■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.15e-20■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 HNRNPH1-205ENST00000502632 1509 ntTSL 214.05□□□□□ -0.165e-20■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.195e-20■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.215e-20■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 HNRNPH1-218ENST00000510678 1996 ntTSL 513.41□□□□□ -0.265e-20■□□□□ 9.1
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 250.9 ms