Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PAX8Q06710 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms