Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAV1Q03135 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms