Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NHLH2Q02577 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms