Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A2Q01362 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms