Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PEX2P28328 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms