Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEBLO76041 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEBLO76041 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEBLO76041 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEBLO76041 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEBLO76041 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEBLO76041 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NEBLO76041 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms