Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms