Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms