Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms