Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms