Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM221AA4D161 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms