Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYVE1Q9Y5Y7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYVE1Q9Y5Y7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms