Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TMED7Q9Y3B3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms