Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCF2Q9UG63 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms