Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBQLN4Q9NRR5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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