Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A2Q9HAB3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC52A2Q9HAB3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms