Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM55Q9BYV6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms