Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOL4Q9BPW4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOL4Q9BPW4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms