Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELF4Q99607 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms