Protein–RNA interactions for Protein: Q96P70

IPO9, Importin-9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO9Q96P70 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IPO9Q96P70 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IPO9Q96P70 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IPO9Q96P70 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IPO9Q96P70 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms