Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLRP3Q96P20 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRP3Q96P20 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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