Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDC1Q96MU7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms