Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms