Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCMH1Q96GD3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms