Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRUQ92729 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms