Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBXN4Q92575 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms