Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF554Q86TJ5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms